Як стверджує член парафіяльної ради собору Надія Петрик, причиною падіння будівлі може стати її вік, вологість грунтів у цій місцевості, вібрація від потягів метро, а також поганий стан даху та фасадного оздоблення. Прихожани храму кажуть, що у його підвалі утворилася цвіль, а фундамент тріщить по швах.
Костел перебуває на балансі Міністерства культури України, адже саме тут десятки років функціанує такий відомий музичний заклад столиці як "Національний будинок органної та камерної музики", у котрого з релігійною громадою непрості стосунки.
Глава парафіяльної ради Станіслав Григорук заявив, що відомство робить неякісну реставрацію. За його словами, за 4 роки на реконструкцію витратили близько 20 млн грн. Але після останнього ремонту міністерству не вистачило грошей на фарбу і будівля покрилася плямами. На 2019 рік держава виділила 80 тис. грн на ремонтні роботи в костелі.
Собор Святого Миколая (також відомий як Будинок органної музики) - це найбільший у Києві католицький храм і єдина в місті будівля неоготичного стилю, що вважається однією з семи чудес України. Костел почали будувати 1899-го за проектом архітекторів Валовського та Городецького.